Wikiversity:Fellow-Programm Freies Wissen/Einreichungen/Open Science für bildgebende Verfahren: Standardisierte Experimente für BIDS/Zwischenbericht
I. Infos zum eigenen Forschungsvorhaben (max. 3000 Zeichen)[Bearbeiten]A. Status Quo: Beschreibe dein Forschungsvorhaben anhand deiner individuellen Roadmap.[Bearbeiten]Ich arbeite an der Ausarbeitung von Hilfestellungen zur Etablierung offener Standards im Sinne der Brain Imaging Data Structure (BIDS) für Labore in den bilgebenden Neurowissenschaftlern. Das Ziel ist es eine Sammlung von Experimentcode bereit zu stellen, der einen Einstieg zu BIDS erleichtert. Die Sammlung wird im Internet frei verfügbar sein und soll um Code von anderen BIDS-Nutzern erweitert werden um möglichst viele Sprachen und Toolboxen zur Verfügung zu haben. Um den Prozess in Schritte aufzuteilen, habe ich eine Roadmap erstellt und die bestehenden Aufgaben in vier Arbeitspakete unterteilt. AP1: Recherche zu Datenformaten, BIDS implementierungen, bestehenden Toolboxen, bestehendem Code, rechtlichen Fragen AP2: Erstellung eigener BIDS kompatibler Scripte, Versionskontrolle AP3: Gewinnung und Zusammenstellung von BIDS-(meta)-Datenscripten für diverse Sprachen/Toolboxen“ AP4: Öffentlichkeitsarbeit, Lobbying und Verbreitung B. Fortschritt: Beschreibe den aktuellen Projektstand auf Basis deiner Roadmap.[Bearbeiten]Seit Beginn der Auftaktveranstaltung habe ich mich mit der Recherche zur bestehenden BIDS infrastruktur beschäftigt (AP1). Anschließend habe ich eigene Experimentaldaten ins BIDS Format umgewandelt und ein tutorial-style script dazu geschrieben (AP2). Dazu habe ich ein Github repository aufgemacht und dort den Prozess dokumentiert (https://github.com/alexvonlautz/FFW_BIDS). Im dritten Teil des Projektes habe ich Kontakt zu mehreren Wissenschaftlern aufgenommen, die sich mit dem Thema beschäftigen. Außerdem habe ich zwei Vorträge zum Thema open science gegeben, einen zu BIDS spezifischer Datenverarbeitung und einen zu offener Wissenschaft. Weiterhin habe ich mich am open review yur Etablierung von BIDS als Standard beteiligt (AP4). C. Ausblick: Was sind die nächsten Schritte? Ist es nach deiner Einschätzung weiterhin realistisch, die gesetzten Ziele/Meilensteine bis zum Ende der Programmlaufzeit zu erreichen oder gibt es wesentliche Veränderungen, die deine Zielsetzung betreffen? Benötigst du zur Erreichung deiner Ziele verstärkt Unterstützung seitens deines Mentors/deiner Mentorin und/oder seitens Wikimedia?[Bearbeiten]Der Großteil der Programmierarbeit ist noch nicht umgesetzt, insbesondere das Erstellen und Zusammentragen von Code ist noch ganz am Anfang. Während der ersten Hälfte der Programmzeit konnte ich aufgrund der Abgabe und Verteidigung meiner Dissertation nicht viel Zeit in das Projekt investieren, in der zweiten Hälfte werde ich mehr Zeit haben. Die Hauptziele, Erlernen und Implementierung von BIDS in meinen Laboren (Berlin + Oxford), erstellen von Experimentalcode und Nutzung dessen durch Andere werden erreichbar sein. Das Recherchieren hat mir aber vor Augen gefügt, dass das Thema Verhaltensdaten in der breiten Öffentlichkeit noch kaum behandelt wird. Auch BIDS beschäftigt sich hauptsächlich mit den Daten bildgebender Verfahren und lässt das Thema am Rande. Deswegen wird als Ausblick die Vernetzung und schließlich das Etablieren von Verhaltensdatenstandards eine Rolle einnehmen. II. Zusammenarbeit mit Fellows sowie Mentorinnen und Mentoren (max. 3000 Zeichen)[Bearbeiten]A. Zusammenarbeit mit deiner Mentorin/deinem Mentor[Bearbeiten]Wie regelmäßig findet ein Austausch statt? Wie/ über welche Kanäle kommuniziert ihr? Wie hilfreich ist der Austausch für dich/ dein Forschungsvorhaben? Was wünschst du dir für die künftige Zusammenarbeit? Wir haben wöchentlichen Austausch vorgenommen, mit kurzer Email und einem Skypeslot, wenn es etwas zu besprechen gibt. Ich konnte von dem Angebot bisher nur wenig gebrauch machen, da ich mit der Dissertation sehr beschäftigt war. Ansonsten war der Austausch sehr hilfreich und Daniel hat von sich aus immer wieder Ideen, Kontaktmöglichkeiten und gute Antworten auf Fragen parat. Ich wünsche mir von der zukünftigen Zusammenarbeit, dass ich selbst mehr zu besprechen habe und die Ressourcen besser nutzen kann. B. Austausch mit anderen Fellows[Bearbeiten]Inwiefern findet ein Austausch statt? Wie/ über welche Kanäle kommuniziert ihr? Wie hilfreich ist der Austausch für dich/ dein Forschungsvorhaben? Was wünschst du dir für die künftige Zusammenarbeit? Wir haben in Berlin einen Stammtisch für den persönlichen Kontakt. Ansonsten läuft die Kommunikation per Emailverteiler. Darüber habe ich mehrfach interessantes Feedback und Input bekommen. Ich habe auch die Integration eines Teils meines Projektes in das eines anderen Fellows vor, das hat sich an der Auftaktveranstaltung als Projekt ergeben. Ich wünsche mir für die Zukunft vor allem eine besseres Kennenlernen und die Integration des Netzwerkes mit anderen. Es wäre gut, wenn z.B. der Stammtisch in Berlin mit einem anderen zu Open Science kombiniert wäre, dann gäbe es immer genug Leute für einen interessanten Abend. Eine Anregung wäre von mir den Projektverlauf und alle Information mehr zu zentralisieren. Dann könnte ich besser feststellen, womit sich meine Kohorte gerade beschäftigt und wie die Projekte von Alumnis weiter verlaufen sind. Da die meisten Fellows eigene Projektblogs, Repositories, persönliche Webseiten etc. haben und dadurch die Information weit verstreut liegt, ist dies nicht so einfach möglich. Eine zentralere Anlaufstelle, wie sie eigentlich im Wiki und den Projektseiten des Fellow Programms vorhanden ist, wäre besser. Ich habe mich genau deswegen dafür entschieden immer alles direkt ins Wiki zu schreiben. III. Kommunikation und Vernetzung (max. 3000 Zeichen)[Bearbeiten]A. Kommunikationsaktivitäten mit Bezug zum Fellow-Programm[Bearbeiten]A. Hast du bereits Kommunikationsaktivitäten mit Bezug zum Fellow-Programm/Offene Wissenschaft (Fachbeiträge und/oder Blogposts) initiiert oder planst du solche? Wenn ja, bitte beschreiben. Den Fortschritt des Codes dokumentiere ich auf dem Github repository des Projektes (s.o.). Bisher habe ich noch keine Vorstellungen geplant, da das Projekt noch recht am Anfang steht. B. Weitergabe von Wissen[Bearbeiten]Konntest du bereits dein Wissen über Offene Wissenschaft an deiner oder an einer anderen wissenschaftlichen Einrichtung (z. B.: über Teilnahme an Veranstaltungen, eigene Vorträge oder Workshops, Gespräche mit Kolleginnen und Kollegen) weitergeben oder auf das Thema Offene Wissenschaft aufmerksam machen? Bitte beschreiben. a. Was hat dabei gut funktioniert? Wo gab es Barrieren/Hindernisse? b. Wo benötigst du künftig Unterstützung von Mentorinnen und Mentoren und/oder seitens Wikimedia (z. B. Materialien (Fellow-Programm Flyer oder Rollup Leihgabe) und/oder Social-Media Unterstützung zur Bewerbung eurer Aktivitäten? An der FU Berlin haben wir eine kleine Projektgruppe gebildet, die sich mit dem Umsetzen von Open Science beschäftigt. Außerdem habe ich mit Studierenden der Neurowissenschaften offene Datenformate besprochen und BIDS vorgestellt. IV. Förderung von Offener Wissenschaft (max. 4000 Zeichen)[Bearbeiten]A. Neue Initiativen zur Förderung Offener Wissenschaft[Bearbeiten]Soweit mir bekannt, haben sich in den letzten Monaten keine neuen Initiativen an meinen Institutionen ergeben. Allerdings ist die FU Berlin bei dem Thema generell eine Vorreiterin und kommuniziert unter anderem über das Fellow Programm direkt. Bisher bin ich allerdings nur innerhalb der Fakultät in die Bestrebungen zur offenen Wissenschaft eingebunden. Außerhalb der Fakultät hat sich in den letzten Tagen jedoch viel getan, insbesondere beim Project DEAL, wo die ersten Verträge mit großen Publishern abgeschloßen wurden. In Kollaboration mit meiner andere Institution, der Universität Oxford, wurde eine sehr interessante Veranstaltung etabliert: Die Berlin-Oxford Summer School on Open Science. Interessanterweise ging es bei dieser sogar um BIDS und mehrere ehemalige Fellows waren in das Programm eingebunden. B. Initiativen zur Förderung Offener Wissenschaften[Bearbeiten]Derzeit sind zwei Initiativen an der FU Berlin geplant. Zum Einen wird darüber gesprochen einen Workshop zu offener Wissenschaft als festen Bestandteil der Promotion zu etablieren. Weiterhin, werden Seminare zu offener Wissenschaft mehr in Masterprogramme aufgenommen. Ich stehe in Kontakt mit den Planenden und hoffe, dass ich einen Beitrag zu beiden Initiativen leisten kann. |