Virus-DNA-Isolierung

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  • 0,75 ml Virus-Stock entnehmen
  • zentrifugieren bei 5000 rpm, 3 min, RT
  • Überstand in neues Eppi geben
  • 750 µl kaltes 20% PEG-8000 in 1M NaCl dazugeben
  • mehrmals invertieren
  • 30 min bei RT stehenlassen
  • zentrifugieren (max rpm), 10 min, RT
  • allen Überstand verwerfen
  • Pellet in 100 µl MQ vorsichtig resuspendieren
  • 10 µl Proteinase K-Lösung (5-10 mg/ml) dazugeben
  • bei 50°C 1h oder bei 4° ÜN inkubieren
  • 110 µl Phenolchloroform-Mischung (1:1) unter Abzug dazugeben
  • zentrifugieren (max rpm), 5 min, RT
  • wässerige (obere) Phase in neues Eppi überführen, Rest in Phenolchloroform-Sonderabfall
  • 1/10 Volumen 3M NaOAc dazugeben
  • 2 Volumen 100% Ethanol dazugeben
  • bei -20°C für 20 min inkubieren
  • zentrifugieren (max rpm), 15 min, 4°C
  • Pellet mit 100 µl 70% Ethanol waschen
  • zentrifugieren (max rpm), 5 min, 4°C
  • Pellet resuspendieren in 10 µl MQ
  • Colony PCR, vorher 2 min denaturieren, Annealing-Temperatur je nach Primer (meist 55-60°C)